决定不予起诉是指嫌疑人行为不构成违犯法律的范畴或标准，纪委处分的是党员违反党规的行为，二者标准不一样，所以不予起诉并不代表纪委不处分。不予起诉的案件，机关应当改变强制措施，或者进行补充侦查，机关认为不起诉的决定有错误的时候，可以要求复议，如果意见不被接受，可以向上一级人民提请复核。
法律依据:
《中国党纪律处分条例》第三十二条，党员犯罪情节轻微，人民依法作出不起诉决定的，或者人民依法作出有罪判决并免予刑事处罚的，应当给予撤销党内职务、留党察看或者开除党籍处分。
《刑事诉讼法》
第一百八十条 对于有被害人的案件，决定不起诉的，人民应当将不起诉决定书送达被害人。被害人如果不服，可以自收到决定书后七日以内向上一级人民申诉，请求提起公诉。人民应当将复查决定告知被害人。对人民维持不起诉决定的，被害人可以向人民起诉。被害人也可以不经申诉，直接向人民起诉。人民受理案件后，人民应当将有关案件材料移送人民。